Das Dorf Bonate Sotto befindet sich in der Provinz Bergamo, die zur Region Lombardei (Lombardia) gehört. Die Gemeinde besitzt 5731 Einwohner und hat eine Fläche von 6,28 Quadratkilometer bei einer Bevölkerungsdichte von 912,58 Einwohner pro Quadratkilometer. Bonate Sotto befindet sich 215 Meter über dem Meeresspiegel.

Die Ortsteile der Gemeinde sind:

Cascine Monzani
Crotti
Manzoni
Molini di Sotto
San Quirico
Sanzio